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直枝理樹與其青梅竹馬的朋友棗恭介、棗鈴等人一起過著全寄宿制的高中生活。他們從小就結成了一個與惡勢力作鬥爭，號稱正義的使者的隊伍，名為「LittleBusters」。升上高中後，某天恭介再提議要組成一個棒球隊伍，隊名沿用「LittleBusters」，於是理樹他們便開始尋找隊員，揮灑著青春的光彩。不久後，理樹和鈴在一隻名為「列儂」的貓身上找到一張紙條，上面寫著：「請找出這個世界的祕密」。